一個罕見HLA—C等位基因間重組家系的遺傳背景研究
摘要：目的 研究HLA-C等位基因座位上的交換重組,探討HLA新等位基因產(chǎn)生的分子遺傳背景.方法 采集擬進行造血干細胞移植的1例慢性粒細胞白血病患者、患者父母以及2名哥哥的靜脈血,采用AlleleSEQR HLA 測序分型試劑進行HLA-A、C、B、DRB1和DQB1共5個位點的高分辨基因分型;再采用Protrans S4 HLA單倍體測序技術(shù)分離2個HLA-C等位基因,以確定序列異常的1個C等位基因;進一步采用分子克隆和測序方法進行患者及父母HLA-C等位基因的全長單倍體序列分析.按遺傳規(guī)律分析該家系的HLA 5個位點的連鎖單倍型,同時將HLA-C等位基因全長序列經(jīng)IMGT/HLA Database中的＂BLAST＂程序進行序列的對比,以確定C等位基因重組發(fā)生的精確位置.結(jié)果 經(jīng)HLA測序及遺傳家系分析,該家系中父親的2條HLA連鎖單倍型分別為a：A＊0207-C＊010201-B＊550201-DRB1＊090102-DQB1＊030302與b：A＊240201-C＊120202-B＊5201-DRB1＊1502-DQB1＊0601;母親的分別為：c：A＊300101-C＊060201-B＊130201-DRB1＊0405-DQB1＊0401與d：A＊110101-C＊070201-B＊4001-DRB1＊080302-DQB1＊0601.患者的2名哥哥均分別正常遺傳了父母的2條單倍體a、d及b、c.患者的2條單倍體分別為母源單倍體c及父源重組單倍體a/b,其中A＊240201來自父親的1條染色單體b,而B＊550201-DRB1＊090102-DQB1＊030302則來自父親的另1條染色單體a.對比患者攜帶的C未知新等位基因與父親的1對C＊010201 、C＊120202等位基因的全長單倍體序列,推斷父親的2條染色單體在減數(shù)分裂時,由于HLA-C等位基因的第273位至330位堿基區(qū)域之間發(fā)生了交換,重組后形成新的C等位基因及單倍型并遺傳給了患者.該C新等位基因的全長序列已遞交GenBank,并被世界衛(wèi)生組織HLA因子命名委員會正式命名為C＊0121.結(jié)論 本研究發(fā)現(xiàn)了1個罕見的中國漢族人群HLA-C基因座位上的基因重組家系,闡明了HLA-C＊0121新等位基因及單倍型的產(chǎn)生來源,為更深入研?
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中華檢驗醫(yī)學雜志
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