摘要:通過(guò)二代測(cè)序、軟件拼接獲得中國(guó)黃海海域黃條鰤(Seriola aureovittata)線粒體基因組全序列。其序列全長(zhǎng)為16609 bp,堿基組成分別為A(26.68%)、G(17.84%)、C(30.12%)和T(25.36%);共有13條蛋白編碼基因, 22個(gè)tRNA基因, 2個(gè)rRNA 基因,除NAD6、trnQ、trnA、trnN、trnC、trnY、trnS、trnE、trnP外,其余基因均在H鏈上編碼。黃條鰤線粒體基因組全序列與蛋白編碼基因的A+T含量分別為52.05%和51.085%,具有明顯的AT偏好性。線粒體基因中存在2個(gè)散在重復(fù)序列,分別位于NAD1基因序列正義鏈的中游和COX2基因序列反義鏈的上游。在其22個(gè)tRNA基因中,除了tRNAGly外,均具有典型的三葉草二級(jí)結(jié)構(gòu)。黃條鰤線粒體基因組的蛋白編碼基因起止位點(diǎn)與密碼子除COX1、NAD5外,均與日本海域出產(chǎn)的黃條鰤(Seriola lalandi)完全吻合,且COX1、NAD5基因皆短于日本黃條鰤;兩者間存在一定的遺傳差異。基于18種隸屬于13屬的鲹科魚(yú)類線粒體基因組全序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),可知小甘鲹(Seriolina nigrofasciata)、黃條鰤、五條鰤(Seriola quinqueradiata)、高體鰤(Seriola dumerili)、長(zhǎng)鰭鰤(Seriola rivoliana)同屬一近支,且黃條鰤與五條鰤親緣關(guān)系最近,與小甘鲹進(jìn)化距離較遠(yuǎn)。
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