O157:H7型大腸埃希菌CRISPR結(jié)構(gòu)及耐藥基因和毒力基因分布分析
摘要：目的了解O157:H7型大腸埃希菌中成簇的規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列(Clustered Regularly Interspaced ShortPalindromic Repeats,CRISPR)結(jié)構(gòu)特征以及耐藥基因和毒力基因分布情況。 方法利用多序列比對(duì)、BLAST、RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測等多種生物信息學(xué)方法對(duì)20株O157:H7型大腸埃希菌的全基因組序列進(jìn)行分析。 結(jié)果從GenBank數(shù)據(jù)庫獲得2000-2014年20株O157:H7型大腸埃希菌全基因組序列,所有基因組中共存在3個(gè)CRISPR位點(diǎn)且每個(gè)CRISPR位點(diǎn)的基因序列具有高度一致性(均超過99.7%);CRISPR2被一段序列分隔為CRISPR2a和CRISPR2b;CRISPR1中存在3個(gè)不同的間隔序列,CRISPR2也有3個(gè)不同的間隔序列,CRISPR3有1個(gè)間隔序列;CRISPR1和CRISPR3的重復(fù)序列均可形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),CRISPR2和CRISPR1的重復(fù)序列具有較高的一致性。共檢測7個(gè)耐藥基因,所有菌株ampc均陽性,4株菌株tetB和sul1陽性,其它4個(gè)基因均未檢出;共檢測6個(gè)毒力基因,有10株細(xì)菌stx1陽性,其他5個(gè)毒力基因20株細(xì)菌均陽性。 結(jié)論CRISPR在O157:H7型大腸埃希菌中廣泛分布且結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,毒力基因分布廣,耐藥性問題不可忽視。
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中國病原生物學(xué)雜志
中國病原生物學(xué)雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅(jiān)持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：論著、調(diào)查研究、綜述等。于1988年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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