Cel48F產物排出過程中酶-底物相互作用及關鍵殘基的分子動力學模擬
作者：劉天志; 董瑩; 鄂鏡雯; 韓菲; 李卓; 張浩 盛實百草藥業有限公司; 天津300000; 吉林大學理論化學研究所; 吉林長春130061; 吉林大學白求恩制藥廠; 吉林長春130012
摘要：使用分子動力學模擬方法,通過對比產物在不同結合位置時的構象和對其相互作用的統計學分析,研究了Cel48F水解前后及產物排出過程中酶與產物間相互作用的變化,揭示了一些關鍵殘基及其作用.結果表明,在底物剛發生水解后,產物主要在Glu 44和Trp 611輔助下向出口移動一個小的距離,使其遠離剩余底物和關鍵催化殘基,防止逆反應發生,在繼續向出口移動過程中,在產物結合裂縫上方的殘基Trp 411的疏水相互作用下,內側糖單元向上方移動并與Trp 411相鄰的Thr 410形成氫鍵,而外側糖單元在Asp 494作用下移動很小,使產物在裂縫中轉動,有利于外界水分子進入并包裹產物,最終實現產物排出.
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沈陽大學學報·自然科學版雜志
沈陽大學學報·自然科學版雜志， 雙月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創新性，刊載內容涉及的欄目：材料與化工、生物與環境、信息與控制、建筑與土木、數學與物理等。于1988年經新聞總署批準的正規刊物。
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