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首頁 > 期刊 > 生物信息學 > 壽命調控同源蛋白Sch9與S6K1的結構與功能分析 【正文】

壽命調控同源蛋白Sch9與S6K1的結構與功能分析

作者:劉雪飛; 范磊; 王楠; 黃新河 西南交通大學生命科學與工程學院; 成都610031

摘要:芽殖酵母Sch9與哺乳動物S6K1是保守的壽命調控同源蛋白,利用生物信息學手段比較分析了Sch9與S6K1的理化性質、亞細胞定位、信號肽和跨膜區、空間結構、蛋白質相互作用網絡、序列同源性及進化關系,以期對Sch9與S6K1的結構功能的深入研究提供線索和基礎。結果表明Sch9為酸性穩定性親水蛋白,而S6K1為酸性不穩定的親水蛋白,均無信號肽和跨膜區域,兩者定位于細胞核的可能性最大。Sch9與S6K1的主要二級結構均為無規卷曲,在進化上相當保守,Sch9屬于C2超家族和PKclike超家族,S6K1屬于PKclike超家族。Sch9相互作用蛋白主要有Cyr1、Tor1、Tor2、Pkh1/2,而S6K1相互作用蛋白主要有PIK3CA、RHEB、Rps6、RPTOR、mTOR,顯示兩者的相互作用蛋白保守性也較強。同時,分析顯示Sch9與S6K1均具有利于蛋白間相互作用的結構特點,為進一步深入研究Sch9與S6K1的分子功能及調控機制提供了一定的理論參考。

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生物信息學雜志

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