馬鈴薯StSRP1的克隆、表達及生物信息學分析
作者：龐鵬湘; 常燕楠; 尉瑞敏; 郜剛 山西師范大學生命科學學院; 臨汾041004
摘要：脅迫相關基因的表達導致代謝物的積累和生化與生理途徑的改變,對于植物適應不利脅迫條件至關重要。通過研究馬鈴薯StSRP1的結構和在逆境脅迫中的表達情況,為驗證馬鈴薯StSRP1在抵抗生物脅迫過程中的作用奠定了基礎。運用電子克隆法獲得StSRP1全長序列,利用生物信息學分析StSRP1的核酸序列、氨基酸序列、蛋白質結構和啟動子,基于NCBI數據庫,選取20條與StSRP1匹配度高的脅迫相關蛋白序列構建了系統進化樹,對不同物種間的SRP蛋白進行比對。經ABA、MJ和病菌的誘導,對StSRP1進行qRT-PCR分析。克隆獲得StSRP1全長867 bp,可編碼288個氨基酸,無信號肽序列,無跨膜區,有34個可能的磷酸化位點,親水性蛋白,定位于內質網。StSRP1的表達受ABA、MJ和病菌的調控。StSRP1可能參與馬鈴薯逆境脅迫應答過程。
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生物技術通報雜志
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