16 S rRNA序列分析法與傳統(tǒng)生化分析法對分枝桿菌分型鑒別的比較研究
作者：葉雅麗; 閆李俠; 黃至澄; 陳保文; 王國治 溫州醫(yī)科大學(xué)附屬黃巖醫(yī)院、臺州市第一人民醫(yī)院檢驗科; 浙江臺州318020; 中國北京中國食品藥品檢定研究院菌苗室
摘要：目的比較16S rRNA序列分析法與傳統(tǒng)生化分析法鑒別54株分枝桿菌模式菌株的異同。方法采用PCR方法擴增54株分枝桿菌模式菌株16S rRNA序列,通過序列比對構(gòu)建發(fā)育樹狀譜,計算相似性,并與傳統(tǒng)生化分析分型結(jié)果進行比較。結(jié)果16S rRNA序列分析可鑒定出41株(41種)分枝桿菌,其它6組(包括13株11種)的分枝桿菌16S rRNA序列兩兩之間相同無法區(qū)別,傳統(tǒng)的生化分析方法難以區(qū)分鳥分枝桿菌和胞內(nèi)分枝桿菌、龜分枝桿菌和偶然分枝桿菌,但采用16S rRNA很容易區(qū)分;16S rRNA基因無法區(qū)分海分枝桿菌與潰瘍分枝桿菌、堪薩斯分枝桿菌和胃分枝桿菌,但采用傳統(tǒng)生化分型方法很容易區(qū)分。結(jié)論在分枝桿菌的分型鑒定方面,分枝桿菌16S rRNA基因序列分析與傳統(tǒng)分型均十分有效,且兩者的聯(lián)合應(yīng)用,能夠提高鑒定的準確性。
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