自噬標志分子ATG8同源蛋白的生物信息
作者：倪志華; 劉阿顯; 楊會然; 樊瑞陽; 李寶庫 河北大學生命科學學院; 保定071002; 河北大學藥學院; 保定071002; 河北省生物工程技術研究中心; 保定071002
摘要：自噬是細胞重要的代謝途徑,ATG8在自噬體形成過程中起著重要的作用。對ATG8蛋白進行生物信息學分析研究十分必要。本研究以NCBI中人ATG8同源蛋白序列數(shù)據(jù)為研究材料,分析其與10種模式生物間基因拷貝數(shù)、氨基酸序列、蛋白質保守位點相關性。結果表明,人6種ATG8同源蛋白分別定位于5條染色體上,均有泛素樣GABARAP結構域。并且,所有模式生物的ATG8同源蛋白中N-端氨基酸序列保守性強于C-端序列。本研究構建的ATG8同源蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,人的ATG8同源蛋白與脊椎動物(斑馬魚,爪蟾,小鼠,大鼠,牛)的ATG8蛋白親緣關系更近,人的GABARAPs與酵母的ATG8蛋白與的親緣關系較近。本研究為研究細胞自噬過程及機制提供了豐富的生物進化和生物信息數(shù)據(jù)支持。
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基因組學與應用生物學雜志
基因組學與應用生物學雜志， 月刊，本刊重視學術導向，堅持科學性、學術性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內容涉及的欄目：綜述與專論、研究論文、研究報告、實驗技術。等。于1982年經新聞總署批準的正規(guī)刊物。
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