3株鴨乙型肝炎病毒全基因組克隆與序列分析
摘要：對(duì)河南南陽(yáng)、安徽亳州、湖北潛江三地鴨血清樣本用PCR進(jìn)行鴨乙型肝炎病毒(DHBV)檢測(cè),并從三地經(jīng)檢測(cè)為DHBV陽(yáng)性的樣本中各挑選1份進(jìn)行DHBV全基因的擴(kuò)增、克隆、測(cè)序及序列分析。結(jié)果顯示,河南南陽(yáng)、安徽亳州、湖北潛江三地的鴨乙型肝炎自然感染率分別為17.6%、13.6%、16.1%,差異不顯著(P>0.05)。河南南陽(yáng)、安徽亳州、湖北潛江3株DHBV基因組全長(zhǎng)分別為3024、3027、3024bp,均含有編碼P、S和C蛋白的3個(gè)開(kāi)放閱讀框。通過(guò)各開(kāi)放閱讀框氨基酸同源性比較,發(fā)現(xiàn)編碼P蛋白的區(qū)域差異較大。全基因序列分析顯示,3株DHBV核苷酸同源性為95.1%~97.4%,與選取的25株參考株同源性為90.3%~96.2%。遺傳進(jìn)化分析及P蛋白關(guān)鍵位點(diǎn)分析結(jié)果表明,3株均為類(lèi)中國(guó)基因型,湖北潛江的DHBV毒株P(guān)蛋白3位-345位關(guān)鍵氨基酸殘基位點(diǎn)與中國(guó)毒株基因型相同,在367位-771位關(guān)鍵氨基酸殘基位點(diǎn)與西方毒株基因型相同,推測(cè)其產(chǎn)生了重組。結(jié)果表明,成功克隆了華中地區(qū)的3株鴨DHBV全基因序列,為DHBV的分子流行病學(xué)調(diào)查提供參考。
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動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅(jiān)持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：研究論文、文獻(xiàn)綜述、專(zhuān)論與講座、獸醫(yī)臨床等。于1980年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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