大豆2S清蛋白基因生物信息學(xué)分析
摘要：2S清蛋白含有動物胰蛋白酶抑制劑及過敏原等多種具有生理活性的多肽,可引起特殊人群尤其是兒童的過敏反應(yīng),其編碼基因為LTP基因家族。為系統(tǒng)地分析2S清蛋白編碼基因,利用生物信息學(xué)分析方法獲得2S清蛋白基因的全序列、定位以及轉(zhuǎn)錄本等信息,鑒定了30個大豆LTP家族基因。基因定位結(jié)果表明:23. 33%基因在染色體上串聯(lián)排布,反映了該家族基因的串聯(lián)重復(fù)進(jìn)化。通過基因功能注釋得到22個非特異性脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,1個類伸展素蛋白,4個脯氨酸蛋白,2個種子儲存2S清蛋白和1個雄蕊特殊蛋白。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析將這些蛋白分成3個類群。類群I有類伸展素蛋白、脯氨酸蛋白、雄蕊特殊蛋白和種子儲存2S清蛋白,類群II有16個非特異性脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,類群III有6個非特異性脂肪轉(zhuǎn)移蛋白。種子儲存2S清蛋白基因在種子發(fā)育中后期特異表達(dá),表達(dá)量顯著高于其它同源基因。本研究為進(jìn)一步研究其功能提供指導(dǎo),為該類基因應(yīng)用于大豆品質(zhì)改良提供理論支撐。
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大豆科學(xué)雜志
大豆科學(xué)雜志， 雙月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進(jìn)性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：遺傳育種·分子生物學(xué)、信息索引、耕作栽培·生理生化、土壤肥料·植物保護(hù)、分析加工、農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)、綜述、新品種等。于1982年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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